Quatorze ans plus tôt. Trois adolescents s'introduisent dans une énorme bâtisse. Alors que les deux premiers montent à l'étage, le troisième se rend dans la cuisine et ouvre le réfrigérateur. Il ne remarque pas l'ombre qui passe derrière lui. Au même moment, l'adolescent entend les hurlements de ses deux amis. Il se précipite vers l'escalier et aperçoit une lumière vacillante venant de l'étage supérieur. Puis, il entend de drôles de bruit et sent que quelque chose se rapproche. Tandis qu'il commence à s'éloigner, terrifié, il découvre une étrange créature assis sur le canapé du salon. La créature a la même couleur que le canapé et regarde l'adolescent avec des grands yeux méchants...
L'Angleterre de nos jours. Au CRA, Nick, Connor et Sarah ont mis en place tout un réseau de câble et de poteaux dans un de leurs bureaux. Lorsque Jenny leur demande ce qu'ils ont construits, Connor lui répond qu'il s'agit d'un modèle tridimensionnel répertoriant toutes les anomalies à travers le temps et l'espace.
En effet, Nick croit que les mythes de toutes les cultures sont fondées sur les anomalies et il est persuadé que le modèle qu'il a construit pourra prédire où s'ouvriront les futures anomalies. D'ailleurs, pour lui la prochaine anomalie se trouve dans une grande bâtisse. Il envoie Abby, Connor et Jenny mener l'enquête.
Arrivés, sur les lieux, ils découvrent une vieille maison délabrée. Ils commencent à l'explorer mais ne trouvent rien de probant. Au cours de l'exploration, Jenny parle à Abby de ses sentiments pour Cutter et Abby lui conseille de révéler au professeur ce qu'elle ressent pour lui. Par la suite, Abby se retrouve seule dans une pièce immense totalement vide. Elle entend alors des bruits étranges. Connor qui est dans une autre pièce, entend Abby crier. Il se précipite mais ne découvre plus personne. Très inquiet, il ne voit pas que quelqu'un arrive par derrière. Connor sursaute quand Abby lui saute dessus en rigolant. La jeune femme est ravie que, pensant qu'elle était en danger, il soit venu à son secours. Après lui avoir déposer un baiser sur la joue, les deux jeunes gens reprennent leurs investigations... sans voir l'étrange créature dissimulée dans la cheminée...
Alors qu'elle est sur le chemin du CRA, Sarah Page est bousculée par une femme. Elle ignore qu'il s'agit d'Helen Cutter. Cette dernière fait mine de l'aider à ramasser ces dossier tombés au sol et s'empare de son pass.
Près de la maison abandonnée, Abby, Connor et Jenny sont interceptés par Danny Quinn, un policier. Ce dernier, les prend pour des cambrioleurs. Bien qu'ils assurent ne faire aucun mal, Danny Quinn leur ordonne de disparaître. Et il les prévient que s'il les retrouve à rôder près de la maison, il n'hésitera pas à les mettre en prison.
En s'assurant qu'ils sont hors de portée du policier, Jenny demande à Abby de rester dans les parages. Puis elle s'éloigne avec Connor pour tenter de trouver des réponses. Tandis qu'ils se séparent, ils ne remarquent pas la petite fille qui les observe de loin...
Pendant ce temps, Helen a envoyé un de ses clones au CRA. Avec la carte volé à Sarah, le clone passe inaperçu. Au même moment, on voit Sarah à l'entrée du CRA, cherchant désespérément son pass. Becker, qui se trouve juste à côté, reçoit un message comme quoi le docteur Sarah Page serait déjà dans le bâtiment. Becker comprend aussitôt qu'il se passe quelque chose d'anormal et se précipite vers les vestiaires. Là, il découvre un homme en train de fouiller le casier de Nick. Becker pointe son arme vers l'inconnu et lui ordonne de se rendre. Mais l'inconnu sort son arme et se retourne brusquement. Becker l'abat sans hésiter. Quand Nick arrive sur les lieux, il a du mal à croire ce qu'il voit: l'homme que Becker a abattu ne lui est pas inconnu puisqu'il l'a vu mourir dans le désert Silurien...
Au poste de police, Danny Quinn demande à son patron de rouvrir le dossier concernant la grande bâtisse. Son patron refuse, considérant que l'affaire est réglée. Il apparaît évident que Danny a un lien avec cette maison et ce qui s'est passé quatorze ans plus tôt.
De leur côté, Jenny et Connor, se font passé pour un couple qui veut acheter l'énorme bâtisse abandonnée. Il se renseigne auprès d'un agent immobilier et, faisant mine de s'intéresser à la maison, ils lui demandent ce qui s'est passé dans cette maison. L'agent immobilier raconte alors l'histoire des trois garçons et leur avoue que l'un des trois, un certain Ryan Mason, est toujours vivant... Connor et Jenny partent immédiatement à sa recherche et le retrouve près du carrousel dont il s'occupe. D'abord réticent, Ryan finit par leur raconter la vérité: que ses amis ont été tués par une étrange créature. Connor et Jenny comprennent que la maison abrite bien une anomalie...
Pendant ce temps, Abby explore la maison et est attaqué par une étrange créature, capable de se camoufler. Elle tombe à la renverse et bascule dans les escaliers avant de perdre connaissance. De retour sur les lieux, Connor et Jenny trouvent la jeune femme, inconsciente. Alors qu'ils la font sortir et qu'ils commencent à s'éloigner, Connor se rend compte qu'il a oublié son téléphone dans la maison. Alors qu'il y retourne, il croise la mystérieuse fillette qui le supplie de ne pas y retourner. Mais Connor n'y fait pas attention et alors qu'il s'apprête à rentrer dans la maison, il est arrêté par Danny Quinn! Alors qu'il se retrouve en prison, Connor supplie Quinn de le laisser sortir. Sans succès. Il parvient néanmoins à obtenir le droit de passer un appel. Connor appelle alors Jenny et lui demande de le sortir de là. Quand Jenny arrive, elle annonce à Danny que cette affaire concerne désormais le gouvernement et qu'il n'a plus son mot à dire...
Au CRA, Nick, Sarah et Becker sont intrigués par l'intrus abattu par Becker. L'hypothèse qu'il est un frère jumeau semblant peu probable, Nick comprend que c'est sûrement Helen qui est derrière tout ça...
Alors que la nuit est tombée, Abby, toujours en poste devant la maison, aperçoit la mystérieuse petite fille. Abby se précipite vers elle quand elle aperçoit que la créature qui l'a attaquée suit la fillette! Elle découvre alors avec stupeur que la mystérieuse petite fille nourrit l'étrange créature! Rassurée, Abby va la voir et lui fait comprendre que c'est elle désormais qui se chargera de la créature...
Le lendemain, tandis qu' Abby surveille la maison, elle voit deux hommes pénétrés à l'intérieur: un agent immobilier et Ryan Mason. Tandis qu' Abby fait la connaissance de ce dernier, ils sont attaqués par la créature. Au même moment, Jenny et Connor font irruption dans la maison et font fuir la créature.
Tous les quatre se rendent alors à l'étage où ils croisent l'agent immobilier. Ce dernier apeuré s'enfuit. Mais il est rattrapé par la créature qui le tue en le faisant basculer dans les escaliers. A ce moment là, Danny Quinn surgit dans la maison en pointant une arme sur Ryan, l'accusant d'être le meurtrier de son petit frère, disparu 14 ans plus tôt. Tandis que Jenny, Connor et Abby essayent de lui faire entendre raison, la créature apparaît et se jette sur Danny, le blessant grièvement. La créature se précipite ensuite vers la pièce où une anomalie vient de s'ouvrir. Tandis que Jenny et Connor, se munissent de leurs armes, Abby leur fait comprendre qu'il ne faut pas lui faire du mal, qu'il faut juste la laisser rentrer chez elle. Ses paroles sont confirmées par la créature qui pénètre l'anomalie. Mais alors que Jenny s'approche, curieuse, la créature ressurgit subitement et les attaque. Danny surgit alors dans la pièce et tire sur la créature qui repasse à travers l'anomalie pour de bon. Danny, qui a survécu grâce à son gilet par balle, comprend alors enfin ce qui est arrivé à son frère...
Tandis que Connor parle à Jenny de la prédiction de Nick qui s'est finalement révélée juste, Abby aperçoit la petite fille en train de jouer plus loin... Quant à Danny, il démissionne de la police parce qu'il pense avoir trouvé un nouvel emploi...
Dans la soirée, Helen s'introduit dans l'appartement de Nick et recueille un échantillon d'ADN. Quand Nick rentre chez lui, Helen se cache et s'éclipse discrètement...
